Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms