Protein–RNA interactions for Protein: P07992

ERCC1, DNA excision repair protein ERCC-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC1P07992 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms