Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms