Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL13O43927 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms