Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms