Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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USP17L12C9JPN9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
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USP17L12C9JPN9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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USP17L12C9JPN9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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USP17L12C9JPN9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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