Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms