Protein–RNA interactions for Protein: A0PJX4

SHISA3, Protein shisa-3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA3A0PJX4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHISA3A0PJX4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SHISA3A0PJX4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms