Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms