Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms