Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF639Q9UID6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF639Q9UID6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms