Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms