Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms