Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4Q9UBX2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms