Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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