Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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