Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms