Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms