Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms