Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms