Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF354BQ96LW1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms