Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms