Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKD1Q969G9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms