Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms