Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIX1LQ8IVB5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIX1LQ8IVB5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms