Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC1Q6VVB1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC1Q6VVB1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms