Protein–RNA interactions for Protein: Q6RI45

BRWD3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRWD3Q6RI45 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRWD3Q6RI45 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRWD3Q6RI45 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms