Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AMER1Q5JTC6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMER1Q5JTC6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms