Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms