Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms