Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LACTB2Q53H82 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms