Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms