Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms