Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KNOP1Q1ED39 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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