Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms