Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms