Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDUFA9Q16795 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms