Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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