Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms