Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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