Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FRMPD4Q14CM0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FRMPD4Q14CM0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms