Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SSPNQ14714 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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