Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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TUBA3CQ13748 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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TUBA3CQ13748 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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TUBA3CQ13748 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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