Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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