Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms