Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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