Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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