Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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