Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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FOXC1Q12948 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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FOXC1Q12948 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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FOXC1Q12948 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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FOXC1Q12948 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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FOXC1Q12948 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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FOXC1Q12948 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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FOXC1Q12948 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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