Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms